Babtų seniūnijos teritoriją suskirstyta į 22 seniūnaitijas (4641 gyventojų). Pagrindiniai sudarymo principai:
1. Kaimas, turintis virš 50 gyventojų galėtų būti seniūnaitija. Prie jo priskiriami mažesni kaimai.
2. Babtai (1744 gyv.), Panevėžiukas (712) ir Pagynė (543) skaidomi į mažesnes seniūnaitijas iki 500 gyventojų – sumažės skirtumas tarp didžiausių ir mažiausių seniūnaitijų.

Seniūnaitijų ir seniūnaičių sąrasas:

1. Babtai – Mokyklos seniūnaitija – visi namai tarp gimnazijos ir miestelio centro, išskyrus Kėdainių 8, - 490 gyventojų.
2. Babtai – Centro seniūnaitija – Prieplaukos, Beržų, Rasos gatvės, Nevėžio g. neporiniai numeriai iki 21, Kėdainių g. daugiabučiai namai, Kauno g. neporiniai numeriai 1-13 ir Babtų k. - 442 gyventojai.
3. Babtai – Daugiabučių seniūnaitija – Kauno g. poriniai numeriai 8-28 – 480 gyventojų.
4. Babtai – Instituto seniūnaitija – Kauno g. neporiniai numeriai nuo 27, poriniai numeriai nuo 30, Sodų, Pavasario, Topolių, Trešnių, Žalgirio, Geležupio, Parko, Kranto g. ir Šašių k. – 451 gyventojas.
5. Panevėžiukas – Mokyklos seniūnaitija – Nevėžio g. daugiabučiai namai nuo 2 iki 11, Taikos, Vikūnų, Vilties, Beržų gatvės, Vikūnų ir Lazdynės kaimai – 341 gyventojas.
6. Panevėžiukas – Striūnos seniūnaitija – likusioji Panevėžiuko dalis – 327 gyventojai.
7. Pagynė – Parko seniūnaitija – Liepų, Sodų, Gevažės, Pagynės 50-mečio, Gojaus, Labūnavos gatvės – 356 gyventojai.
8. Pagynė – Žemdirbių seniūnaitija – Žemdirbių, Mechanizatorių, Antagynėlės, Kikonių, Linelių, Gynios gatvės – 182 gyventojai.
9. Antagynės k. – 61 gyventojas.
10. Stabaunyčiaus k. 54 gyv., Gailiušių k. 7 gyv., - iš viso 61 gyventojas.
11. Muniškių k. 364 gyv., Juodonių k.38 gyv. – iš viso 399 gyventojai.
12. Sitkūnų k. – 191 gyventojai.
13. Urnėžių k. 51 gyv., Berlainių k. 10 gyv., Kačergių k. 1 gyv., Kikonių k. 5 gyv., Pakapių k. 19 gyv., - iš viso 86 gyventojai.
14. Vilkėnų k. – 74 gyventojai.
15. Jugintų k. – 92 gyventojai.
16. Dasiūnų k. – 56 gyventojai.
17. Piepalių k. – 222 gyventojai.
18. Vosiškių k. 66 gyv., Žemaitkiemio k. 18 gyv., Naujatriobių k. 17 gyv., Pavejuonio k. 5 gyv., Eglynų k. 3 gyv. – iš viso 109 gyventojai.
19. Vareikonių k. – 64 gyventojai.
20. Kaniūkų k. – 93 gyventojai.
21. Gaižuvėlės k. 50 gyv., Krivėnų k. 18 gyv., - iš viso 68 gyventojai.
22. Karalgirio k. 68 gyv., Selveravos k. 21 gyv., Naujasodžių k. 28 gyv. – iš viso 117 gyventojų.